Bioinformatikus

Hely: Budapest
Cég: Magyarságkutató Intézet
Kategória: Oktatás, Tudomány, Sport

Új generációs szekvenálási (NGS) adatok – kiemelten archaikus DNS (aDNA) szekvenciák – bioinformatikai feldolgozása, minőségellenőrzése, igazítása (alignment) és variánsazonosítása.Archaikus DNS-re jellemző károsodási mintázatok (deamináció, DNS-fragmentáció) elemzése és szűrése (pl. mapDamage).Populációgenetikai elemzések elvégzése és modellezése (pl. PCA, ADMIXTURE, qpAdm/qpGraph, f-statisztikák, IBD szegmensek vizsgálata).Reprodukálható bioinformatikai csővezetékek (pipelines) fejlesztése és karbantartása Linux/Unix környezetben (pl. Nextflow, Snakemake, Python, R).Genotipizálási és imputálási munkafolyamatok kezelése VCF és kapcsolódó fájlformátumokon.Szoros együttműködés a molekuláris biológiai wet-lab csapattal, archeológusokkal és történészekkel az eredmények biológiai és történeti értelmezésében.Tudományos publikációk, elemzési riportok és szakmai beszámolók elkészítésében való aktív részvétel. MSc vagy PhD bioinformatika, számítógépes biológia, molekuláris genetika vagy kapcsolódó természettudományi területen.Bizonyított tapasztalat NGS adatok feldolgozásában és a leggyakoribb bioinformatikai eszközök (pl. BWA, SAMtools, bcftools) használatában.Magabiztos R és/vagy Python nyelvtudás a releváns adatelemző és statisztikai könyvtárak ismeretével.A molekuláris genetika és a populációgenetikai alapfogalmak mélyreható ismerete.Kiváló problémamegoldó és kommunikációs készség: a komplex elemzési eredmények érthető prezentálása a multidiszciplináris csapat többi tagja számára. Archaikus DNS (aDNA) specifikus szoftverek ismerete (pl. EIGENSOFT, AdmixTools, ancIBD).Imputációs és genotipizálási pipelines használatában szerzett tapasztalat (pl. GLIMPSE, Minimac4).Magas teljesítményű számítástechnikai (HPC) környezetek vagy felhőalapú infrastruktúrák ismerete.Git/GitHub magabiztos használata verziókövetésre és kódmegosztásra.Tudományos publikációs háttér archeogenetikai vagy populációgenetikai területen. A Magyarságkutató Intézet közalkalmazotti jogviszonyba Bioinformatikus munkatársat keres,  NGS szekvenciák elemzésére és archeogenetikai kutatások támogatására. A pozíció ideális olyan szakember számára, aki elhivatott a molekuláris populációgenetika iránt, és computational módszerekkel kíván hozzájárulni archaikus DNS-minták vizsgálatához.

Címkék: Alkalmazotti jogviszony, Egyetem

profession.hu - 17 napja

További információ és jelentkezés